Родился 13 июля 1959 года в селе Воздвиженском Апанасенковского района Ставропольского края. В 1976 году окончил Новопавловскую среднюю школу №1 Кировского района Ставропольского края. В 1981 году с отличием окончил факультет механизации Кубанского сельскохозяйственного института и начал работать инженером-технологом на заводе "Сатурн" города Краснодара.

С 1971 по 1975 год работал штурвальным совхоза "Красный Маныч" Туркменского района Ставропольского края (в период обучения в средней общеобразовательной школе).

1976-1981 гг. учился в Кубанском ордена Трудового Красного Знамени сельскохозяйственном институте (г.Краснодар). Одновременно с учебой трудился в качестве рабочего опытно-семеноводческого хозяйства "Березанское" Краснодарского края, колхоза "За мир" Северского района Краснодарского края, инженера-технолога Краснодарского опытного завода "Сатурн".

1982 г. – заведующий отделом пропаганды и культурно-массовой работы, второй секретарь Кировского райкома ВЛКСМ, г.Новопавловск Кировского района Ставропольского края.

1982-1983 гг. – инструктор, заместитель заведующего отделом рабочей и сельской молодежи Ставропольского крайкома ВЛКСМ. 1983-1985 гг. – первый секретарь Изобильненского райкома ВЛКСМ (г.Изобильный Ставропольского края). 1985-1990 гг. – секретарь, второй, первый секретарь Ставропольского крайкома ВЛКСМ.

1990-1994 гг. – председатель постоянной комиссии по делам молодежи Ставропольского краевого Совета народных депутатов.

1994-1995 гг. – старший преподаватель кафедры государственно-правовых дисциплин Ставропольского университета.

1995-1996 гг. – депутат Государственной Думы Федерального Собрания Российской Федерации второго созыва, член фракции КПРФ, член Комитета по законодательству и судебно-правовой реформе.

С 16 ноября 1996 г. избран губернатором Ставропольского края, в связи с чем сложил полномочия депутата Государственной Думы РФ. 18 декабря 2000 г. был избран губернатором на второй срок, победив во втором туре выборов 17 декабря бывшего председателя правительства Ставропольского края С.Ильясова.

С 1996 г. по январь 2001 г. по должности входил в Совет Федерации Федерального Собрания РФ, был членом Комитета по международным делам.

26 сентября 2005 г. А.Черногоров подал Президенту России В.Путину заявление о досрочном сложении полномочий губернатора Ставропольского края и, одновременно, поставил перед главой государства вопрос о доверии. 22 октября 2005 г. в соответствии с новым законодательством В.Путин внес на рассмотрение депутатов Государственной Думы Ставропольского края кандидатуру А.Черногорова для наделения его полномочиями губернатора края. 31 октября 2005 г. депутаты местного законодательного собрания единогласно проголосовали за кандидатуру, предложенную президентом России.

Избирался секретарем краевого комитета КПРФ, первым секретарем Ставропольского горкома КПРФ. 13 ноября 2006 г. вступил в партию "Единая Россия".

Член Государственного Совета Российской Федерации, доктор экономических наук (17.06.2004), профессор (24.06.2004), воинское звание - полковник запаса.

Награжден орденом Дружбы, медалью "За отличие в охране государственной границы", медалью Европейской Общественной Комиссии "За полезные обществу труды", медалью Анатолия Кони, золотой медалью "За миротворческую и благотворительную деятельность", орденами Святого Благоверного князя Даниила Московского (2003 г.), Петра Великого I степени (2004 г.), Ю.В.Андропова (2004 г.), званием "Почетный общественный "Лидер российской экономики" и другими медалями и грамотами.

Лауреат Национальной Экологической Премии "ЭкоМир", Национальной премии "Серебряный лучник", Национальной премии им.Петра Великого. Действительный член Российской Академии проблем безопасности, обороны и правопорядка, и Международной академии информационных технологий (МАИТ г. Минск). В 2002 году имя Губернатора, как политика новой формации, занесено во влиятельный британский сборник "Кто есть кто" (Кембридж). В 2003 году решением Городской Думы краевого центра Александру Черногорову присвоено звание Почетного гражданина города Ставрополя.

На выборах Ставропольской краевой думы 11 марта 2007 года возглавил партийный список "Единой России".

Женат. Воспитывает двух дочерей и сына.