По решению президента Азербайджана, срок заключения в колонии строгого режима бывшего министра национальной безопасности Наримана Имранова, осужденного в 1994 г., был сокращен с пожизненного до 15 лет. Алиев амнистировал также 10 осужденных за бунт и попытку госпереворота в Гяндже и 39 осужденных за подготовку вооруженного бунта в 1995 г. в Баку, Газахе и Акстафе.

Среди отпущенных на свободу числятся два преступника, осужденных за попытки покушения на жизнь президента Азербайджана в июле и августе 1995 года. Под амнистию также попали семь представителей Общества инвалидов Карабаха, недавно осужденных за беспорядки в Баку в январе?феврале 2001 года.

В январе 2001 г. президент Азербайджана помиловал более 2 тыс. человек в связи с принятием Азербайджана в Совет Европы. В целом за семь лет в результате шести актов об амнистии в Азербайджане было помиловано более 55 тыс. осужденных, из которых вышли на свободу 16 тыс. человек.